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VMD (current) Compound Index

  _  
colvarbias_restraint_harmonic_walls   My_Fl_Positioner   
_py3_inittab   colvarbias_restraint_histogram   myBrowser   
  A  
colvarbias_restraint_k   myFl_Chart   
abuf   colvarbias_restraint_k_moving   myglwindow   
ANARIDisplayDevice   colvarbias_restraint_linear   
  N  
ANARIRender   colvarbias_restraint_moving   n_matrix (UIestimator)   
Animation   colvarbias_reweightaMD   n_vector (UIestimator)   
anr_cylinder_array_color   colvarbias_ti   NameList   
anr_directional_light   colvardeps   NanoShaperCoord   
anr_material   colvardeps::feature   NanoShaperFace   
anr_positional_light   colvardeps::feature_state   NanoShaperInterface   
anr_sphere_array_color   colvarmodule   netint   
anr_trimesh_v3f_n3f_c3f   colvarmodule::matrix2d   nvencfctns   
ArithmeticPathBase (ArithmeticPathCV)   colvarmodule::matrix2d::row   NVENCMgr   
ArtDisplayDevice   colvarmodule::quaternion   
  O  
atom   colvarmodule::rmatrix   occthrparms_t   
atom_group   colvarmodule::rotation   oglhandle   
AtomColor   colvarmodule::rvector   OpenGLCache   
AtomData   colvarmodule::vector1d   OpenGLDisplayDevice   
AtomEntry   colvarparams   OpenGLExtensions   
AtomGrid   colvarparse   OpenGLPbufferDisplayDevice   
AtomGridCell   colvarparse::read_block   OpenGLRenderer   
atomic_int_struct   colvarproxy   OpenGLShader   
AtomList   colvarproxy_atom_groups   OptiXDisplayDevice   
atomparser_node   colvarproxy_atoms   OptiXRenderer   
atomparser_string   colvarproxy_io   Orbital   
AtomPosType   colvarproxy_replicas   orbital_cbdata   
AtomRep   colvarproxy_script   orbthrparms   
AtomRepDataInfo   colvarproxy_smp   ort_directional_light   
AtomRepParamStruct   colvarproxy_system   ort_material   
AtomSel   colvarproxy_tcl   ort_positional_light   
atomsel_ctxt   colvarproxy_vmd   OsgNavigator   
atomsel_iterobject   colvarproxy_volmaps   osp_cylinder_array_color   
AtomSelThr   colvarscript   osp_directional_light   
Axes   colvarvalue   osp_material   
axis   Combinations   osp_positional_light   
  B  
Command   osp_sphere_array_color   
barrier_struct   CommandQueue   osp_trimesh_v3f_n3f_c3f   
BaseMolecule   compile_data   OSPRay2DisplayDevice   
basis_atom_t   ComputeOccupancyMap_t   OSPRay2Renderer   
Best   CoorData   OSPRayDisplayDevice   
BinOfAtoms   CoorPluginData   OSPRayRenderer   
bond   ctxt   
  P  
bondlist   CUDAAccel   ParseTree   
bondsearchthrparms   cudadevprops   PBCControls   
busbwthrparms   CUDAMarchingCubes   PerRayData_radiance   
Buttons   CUDAQuickSurf   PerRayData_shadow   
  C  
  D  
PhoneButtons   
CaveButtons   DeltaCounter   PhoneTracker   
CaveDisplayDevice   densitythrparms   Pickable   
CaveScene   DepthSortObject   PickAtomCallbackEvent   
CaveTracker   DirectionalLight   PickAtomEvent   
clusterparms_t   DirectionalLightList   PickEvent   
CmdAddAtomSelMacro   DispCmdBeginRepGeomGroup   PickGraphicsEvent   
CmdAnimDelete   DispCmdColorIndex   PickList   
CmdAnimDir   DispCmdComment   PickMode   
CmdAnimDup   DispCmdCone   PickModeAddBond   
CmdAnimJump   DispCmdCylinder   PickModeAngles   
CmdAnimNewFrame   DispCmdLatticeCubeArray   PickModeAtoms   
CmdAnimNewNumFrames   DispCmdLine   PickModeBonds   
CmdAnimSkip   DispCmdLineArray   PickModeCenter   
CmdAnimSpeed   DispCmdLineType   PickModeDihedrals   
CmdAnimStyle   DispCmdLineWidth   PickModeForce   
CmdAnimWriteFile   DispCmdLitPointArray   PickModeForceAtom   
CmdColorChange   DispCmdPickPoint   PickModeForceFragment   
CmdColorItem   DispCmdPickPointArray   PickModeForceResidue   
CmdColorName   DispCmdPoint   PickModeList   
CmdColorScaleColors   DispCmdPointArray   PickModeMolLabel   
CmdColorScaleMethod   DispCmdPolyLineArray   PickModeMove   
CmdColorScaleSettings   DispCmdSphere   PickModeMoveAtom   
CmdDelAtomSelMacro   DispCmdSphereArray   PickModeMoveFragment   
CmdDisplayAAOn   DispCmdSphereRes   PickModeMoveMolecule   
CmdDisplayAOAmbient   DispCmdSphereType   PickModeMoveRep   
CmdDisplayAODirect   DispCmdSquare   PickModeMoveResidue   
CmdDisplayAOOn   DispCmdText   PickModeUser   
CmdDisplayAxes   DispCmdTriangle   PickSelectionEvent   
CmdDisplayBackgroundGradientOn   DispCmdTriMesh   PickValueEvent   
CmdDisplayCacheMode   DispCmdTriStrips   PinchTool   
CmdDisplayClip   DispCmdVolSlice   PlainTextInterp   
CmdDisplayClipFar   DispCmdVolumeTexture   plane   
CmdDisplayClipFarRel   DispCmdWireMesh   PluginMgr   
CmdDisplayClipNear   Displayable   PointDistance   
CmdDisplayClipNearRel   DisplayColor   PointGroupDefinition   
CmdDisplayCueDensity   DisplayDevice   PositionalLight   
CmdDisplayCueEnd   DisplayFltkMenu   PositionalLightList   
CmdDisplayCueMode   DisplayRocker   POV3DisplayDevice   
CmdDisplayCueStart   DrawForce   prim_t   
CmdDisplayCullingOn   DrawMolecule   PrintTool   
CmdDisplayDepthcueOn   DrawMoleculeMonitor   PSDisplayDevice   
CmdDisplayDoFFNumber   DrawMolItem   ptrstack   
CmdDisplayDoFFocalDist   DrawTool   PyAtomSelObject   
CmdDisplayDoFOn   
  E  
PythonEvalEvent   
CmdDisplayEyesep   elementsummary   PythonTextInterp   
CmdDisplayFocallen   enthrparms   
  Q  
CmdDisplayFPSOn   eventdataunion   qcprmsdthreadparms   
CmdDisplayLightHL   
  F  
QMData   
CmdDisplayLightMove   Feedback   QMTimestep   
CmdDisplayLightOn   FileChooserFltkMenu   Quat   
CmdDisplayLightRot   FileRenderer   QuickSurf   
CmdDisplayProj   FileRenderer::AdvancedLightState   quicksurf_cbdata   
CmdDisplayRenderMode   FileRenderer::LightState   
  R  
CmdDisplayScreenDistance   FileRenderList   R3dDisplayDevice   
CmdDisplayScreenHeight   FileSpec   RadianceDisplayDevice   
CmdDisplayShadowOn   FindWithinData   RadiusCounter   
CmdDisplayStageLocation   flint_t   RayShadeDisplayDevice   
CmdDisplayStagePanels   FltkOpenGLDisplayDevice   rdfthrparms   
CmdDisplayStageSize   FPS   real_pcre   
CmdDisplayStereo   Fragment   real_pcre_extra   
CmdDisplayStereoSwap   FrameEvent   RenderFltkMenu   
CmdIMDConnect   FrameSelector   RenderManDisplayDevice   
CmdIMDCopyUnitCell   FreeVRButtons   RepChoice   
CmdIMDRate   FreeVRDisplayDevice   RepChoiceSmall   
CmdIMDSim   FreeVRScene   Residue   
CmdLabelAdd   FreeVRTracker   ResizeArray   
CmdLabelAddspring   
  G  
ResolutionCounter   
CmdLabelDelete   GaussianBlur   RibbonFrame   
CmdLabelShow   GelatoDisplayDevice   RotateTool   
CmdLabelTextFormat   GeometricPathBase (GeometricPathCV)   
  S  
CmdLabelTextOffset   GeometryAngle   sasathreadparms   
CmdLabelTextSize   GeometryAtom   SaveTrajectoryFltkMenu   
CmdLabelTextThickness   GeometryBond   ScaleSpaceFilter   
CmdMaterialAdd   GeometryDihedral   Scene   
CmdMaterialChange   GeometryFltkMenu   Segmentation   
CmdMaterialDefault   GeometryList   SelectionBuilder   
CmdMaterialDelete   GeometryMol   SensorConfig   
CmdMaterialRename   GeometryMonitor   shell_t   
CmdMenuExtensionAdd   GeometrySpring   ShortSlider   
CmdMenuExtensionRemove   GeomListStruct   simenc_handle   
CmdMenuShow   globmembwthrparms   SmallRing   
CmdMobileMode   glsl_shader   SmallRingLinkages   
CmdMolActive   glwin_ext_fctns   SnapshotDisplayDevice   
CmdMolAddRep   glwin_fbo_target   SortableArray   
CmdMolBondsRecalc   glwin_warp_hmd   Spaceball   
CmdMolCancel   glxdata   SpaceballButtons   
CmdMolChangeRep   gofrparms_t   spaceballevent   
CmdMolChangeRepItem   gpuqcprmsdthreadparms   SpaceballEvent   
CmdMolColor   gpuseg_temp_storage   spaceballhandle   
CmdMolDelete   GrabTool   SpaceballTracker   
CmdMolDeleteRep   GraphicsFltkMenu   SpringTool   
CmdMolDrawFrames   GraphicsFltkRep   SQUARECELL   
CmdMolFix   GraphicsFltkRepBeads   Stack   
CmdMolLoad   GraphicsFltkRepBonds   Stage   
CmdMolMaterial   GraphicsFltkRepCartoon   state_t   
CmdMolNew   GraphicsFltkRepCPK   StepCounter   
CmdMolNumPeriodic   GraphicsFltkRepDotted   STLDisplayDevice   
CmdMolOn   GraphicsFltkRepDynamicBonds   Surf   
CmdMolReanalyze   GraphicsFltkRepFieldLines   symbol_data   
CmdMolRename   GraphicsFltkRepHBonds   SymbolTable   
CmdMolRep   GraphicsFltkRepIsosurface   SymbolTableElement   
CmdMolRepColorUpdate   GraphicsFltkRepLicorice   Symmetry   
CmdMolRepSelUpdate   GraphicsFltkRepLines   
  T  
CmdMolScaleMinmax   GraphicsFltkRepMSMS   TachyonDisplayDevice   
CmdMolSelect   GraphicsFltkRepNanoShaper   TclEvalEvent   
CmdMolShowInstances   GraphicsFltkRepNewCartoon   TclTextInterp   
CmdMolShowPeriodic   GraphicsFltkRepNewRibbons   TextInterp   
CmdMolShowRep   GraphicsFltkRepOrbital   Timestep   
CmdMolSmoothRep   GraphicsFltkRepOrbital::minmax   TimestepEvent   
CmdMolSSRecalc   GraphicsFltkRepPoints   Tool   
CmdMolTop   GraphicsFltkRepQuickSurf   ToolFltkMenu   
CmdMolVolume   GraphicsFltkRepRibbons   TrajectoryReadEvent   
CmdMouseMode   GraphicsFltkRepSolvent   TRIANGLE   
CmdPluginUpdate   GraphicsFltkRepSurf   TugTool   
CmdRender   GraphicsFltkRepTrace   
  U  
CmdRenderOption   GraphicsFltkRepTube   UIestimator (UIestimator)   
CmdResetView   GraphicsFltkRepVDW   UIObject   
CmdRockOff   GraphicsFltkRepVolumeSlice   UIText   
CmdRockOn   GraphicsFltkRepVolumetric   UIVR   
CmdRotate   GraphicsFltkRepVolumetric::minmax   usage   
CmdRotMat   GraphLabelEvent   UserKeyEvent   
CmdScale   GraphLayout   
  V  
CmdSpaceballMode   GRIDCELL   Vector3D   
CmdToolAddDevice   GridList   VideoStream   
CmdToolCallback   GridResCounter   vmd_cylinder   
CmdToolChange   GridSearchPair   vmd_cylinder_color   
CmdToolCreate   GridSearchPairlist   vmd_opencl_orbital_handle   
CmdToolDelete   group_t   vmd_ring_color   
CmdToolDeleteDevice   
  H  
vmd_sphere   
CmdToolOffset   hash_node_t   vmd_sphere_color   
CmdToolRep   hash_t   vmd_tricolor   
CmdToolScale   HelpEvent   vmd_trimesh_c4u_n3b_v3f   
CmdToolScaleForce   hersheyhandle   vmd_trimesh_n3b_v3f   
CmdToolScaleSpring   HMDMgr   vmd_trimesh_n3f_v3f   
CmdTranslate   
  I  
vmd_trimesh_v3f   
ColorFltkMenu   IdList   VMDApp   
ColorScale   IMDEnergies   VMDClipPlane   
ColorscaleImage   IMDheader   VMDCollab   
ColorscaleLumaChart   IMDMgr   VMDDIR   
ColorScaleTypeInfo   IMDSim   VMDDisplayList   
colvar   IMDSimBlocking   VMDDisplayList::VMDLinkIter   
colvar::alch_Flambda   IMDSimThread   VMDFltkMenu   
colvar::alch_lambda   IndexList   VMDMenu   
colvar::alpha_angles   Inform   VMDTempFile   
colvar::angle   InitializeStructureEvent   VMDTitle   
colvar::aspathCV   integrate_potential   VMDTkinterMenu   
colvar::azpathCV   InterpEvent   VMDTkMenu   
colvar::cartesian   InterpParams_t   VMDTracker   
colvar::CartesianBasedPath   inthash_node_t   vmdwinjoystick   
colvar::componentDisabled   inthash_t   VolMapCreate   
colvar::coordnum   intstack   VolMapCreateCoulombPotential   
colvar::CVBasedPath   IsoContour   VolMapCreateCoulombPotentialMSM   
colvar::cvc   IsoSlider   VolMapCreateDensity   
colvar::dihedPC   IsoSurface   VolMapCreateDistance   
colvar::dihedral   isosurface_cbdata   VolMapCreateILS   
colvar::dipole_angle   
  J  
VolMapCreateInterp   
colvar::dipole_magnitude   JoystickTool   VolMapCreateMask   
colvar::distance   JRegex   VolMapCreateOccupancy   
colvar::distance_dir   JString   VolumeTexture   
colvar::distance_inv   
  L  
VolumetricData   
colvar::distance_pairs   latthrparms   VRJugglerButtons   
colvar::distance_vec   LibGelatoDisplayDevice   VRJugglerDisplayDevice   
colvar::distance_xy   LibTachyonDisplayDevice   VRJugglerScene   
colvar::distance_z   LINE   VRJugglerSharedData   
colvar::eigenvector   linenoiseCompletions   VRJugglerTracker   
colvar::euler_phi   linenoiseState   Vrml2DisplayDevice   
colvar::euler_psi   LinkageEdge   VrmlDisplayDevice   
colvar::euler_theta   LinkagePath   VRPNButtons   
colvar::groupcoordnum   LogfileEvent   VRPNFeedback   
colvar::gspath   
  M  
VRPNTracker   
colvar::gspathCV   M_VRJapp   VRPNTrackerUserData   
colvar::gyration   maddthrparms   VSMsgHeader_t   
colvar::gzpath   MainFltkMenu   
  W  
colvar::gzpathCV   match_data   Watershed   
colvar::h_bond   Material   watershed_gpu_state_t   
colvar::inertia   MaterialFltkMenu   wavef_signa_t   
colvar::inertia_z   MaterialList   WavefrontDisplayDevice   
colvar::linearCombination   Matrix4   Wavefunction   
colvar::map_total   MayaDisplayDevice   Win32Joystick   
colvar::neuralNetwork   Mobile   wkf_cpu_caps_struct   
colvar::orientation   MobileButtons   wkf_run_barrier_struct   
colvar::orientation_angle   MobileDeviceCommandEvent   wkf_shared_iterator_struct   
colvar::orientation_proj   MobileEvent   wkf_tasktile_struct   
colvar::polar_phi   mobilehandle   wkf_threadlaunch_struct   
colvar::polar_theta   MobileStateChangedEvent   wkf_threadpool_struct   
colvar::rmsd   MobileTracker   wkf_threadpool_workerdata_struct   
colvar::selfcoordnum   MolAtom   wkf_tilestack_t   
colvar::spin_angle   MolBrowser   wkf_timer   
colvar::tilt   MolData   wkfmsgtimer   
colvar_grid   Molecule   wrap_nvml_handle   
colvar_grid_count   MoleculeEvent   wrap_nvmlPciInfo_t   
colvar_grid_gradient   MoleculeGraphics   
  X  
colvar_grid_scalar   MoleculeList   X3DDisplayDevice   
colvarbias   MolFilePlugin   X3DOMDisplayDevice   
colvarbias_abf   Mouse   xidevhandle   
colvarbias_alb   MouseModeEvent   xinputhandle   
colvarbias_histogram   MousePositionEvent   XY   
colvarbias_meta   Msmpot_t   XYZ   
colvarbias_meta::hill   MsmpotCuda_t   
  Y  
colvarbias_restraint   MSMSCoord   yy_buffer_state   
colvarbias_restraint_centers   MSMSFace   YYSTYPE   
colvarbias_restraint_centers_moving   MSMSInterface   yytoktype   
colvarbias_restraint_harmonic   

Generated on Mon Nov 11 02:46:31 2024 for VMD (current) by doxygen1.2.14 written by Dimitri van Heesch, © 1997-2002