From: andrea spitaleri (spitaleri.andrea_at_hsr.it)
Date: Fri Aug 04 2006 - 04:41:00 CDT

Hi all,
quick and I guess easy question:
I have a cubic box of water+protein and I'd like to visualize the protein and water molecules lying
on the edge of the box. That what I did:
set pro [atomselect 0 "protein"]
set edge [atomselect 0 "water and not (water within 10 of protein)"]
Is it correct or there is a quickest way?. And then what about for a triclinic and octahedron box?
How do I set the different cutoff long the xyz directions?
Thanks in advance

Regards

andrea

-- 
-------------------------------
Andrea Spitaleri
Dulbecco Telethon Institute
c/o DIBIT Scientific Institute
Biomolecular NMR, 1B4
Via Olgettina 58
20132 Milano (Italy)
http://biomolecularnmr.ihsr.dom/
-------------------------------
********************************************************************
Sostieni la ricerca del San Raffaele con il 5permille!
E' SEMPLICE E NON COSTA NULLA.
Basta indicare nell'apposito riquadro della dichiarazione dei
redditi ("Ricerca sanitaria") 
il codice fiscale della 
Fondazione Centro S. Raffaele del Monte Tabor:
03 06 42 80 153 e ricordarsi di firmare.
Se vuoi saperne di piu' scrivi a 5permille_at_hsr.it o vai sul sito
www.5xmille.org