VMD-L Mailing List

From: John Stone (johns_at_ks.uiuc.edu)
Date: Sat Feb 14 2009 - 14:32:53 CST

Hi,
  Which version of VMD did you install on your system? It seems
that you may have installed one of the 64-bit VMD builds on a system
that's 32-bit, or that you may have installed an Itanium (IA64) version
on an x86 machine. Can you verify you've installed either LINUX or
LINUXAMD64 (the only two that work for x86)?

Cheers,
  John Stone
  vmd_at_ks.uiuc.edu

On Sat, Feb 14, 2009 at 07:34:02AM -0800, Fernanda S. wrote:
> Hi!
>  
> I tried to follow the instructions in the VMD Linux release notes???.
>  
> Went to text mode (pressing Ctrl+Alt+F1), login in as root and typing vmd ???dispdev text (i've tried doing without login as root too, same error occurred).
>  
> What showed was:
> /usr/local/lib/vmd/vmd_LINUX: command not found
>  
> I???ve installed the libstdc++.so.5 (libstdc++5-3.3.6-4mdv2009.0.i586..rpm). Didn't make any difference.
>  
> If I type glxinfo (it doesn???t seem, to me, that there is any error or warning):
>  
> [root_at_mandrivalinux fernanda]# glxinfo
> name of display: :0.0                                                          
> display: :0  screen: 0                                                         
> direct rendering: Yes                                                           
> server glx vendor string: NVIDIA Corporation                                   
> server glx version string: 1.4                                                 
> server glx extensions:                                                          
>     GLX_EXT_visual_info, GLX_EXT_visual_rating, GLX_SGIX_fbconfig,             
>     GLX_SGIX_pbuffer, GLX_SGI_video_sync, GLX_SGI_swap_control,                
>     GLX_EXT_texture_from_pixmap, GLX_ARB_create_context, GLX_ARB_multisample,  
>     GLX_NV_float_buffer, GLX_ARB_fbconfig_float, GLX_EXT_framebuffer_sRGB      
> client glx vendor string: NVIDIA Corporation                                   
> client glx version string: 1.4                                                 
> client glx extensions:                                                         
>     GLX_ARB_get_proc_address, GLX_ARB_multisample, GLX_EXT_visual_info,        
>     GLX_EXT_visual_rating, GLX_EXT_import_context, GLX_SGI_video_sync,         
>     GLX_NV_swap_group, GLX_NV_video_out, GLX_SGIX_fbconfig, GLX_SGIX_pbuffer,  
>     GLX_SGI_swap_control, GLX_ARB_create_context, GLX_NV_float_buffer,         
>     GLX_ARB_fbconfig_float, GLX_EXT_fbconfig_packed_float,                     
>     GLX_EXT_texture_from_pixmap, GLX_EXT_framebuffer_sRGB,                     
>     GLX_NV_present_video, GLX_NV_multisample_coverage                          
> GLX version: 1.3                                                               
> GLX extensions:                                                                 
>     GLX_EXT_visual_info, GLX_EXT_visual_rating, GLX_SGIX_fbconfig,             
>     GLX_SGIX_pbuffer, GLX_SGI_video_sync, GLX_SGI_swap_control,                
>     GLX_EXT_texture_from_pixmap, GLX_ARB_create_context, GLX_ARB_multisample,  
>     GLX_NV_float_buffer, GLX_ARB_fbconfig_float, GLX_EXT_framebuffer_sRGB,     
>     GLX_ARB_get_proc_address                                                   
> OpenGL vendor string: NVIDIA Corporation                                        
> OpenGL renderer string: GeForce 9100M G/PCI/SSE2/3DNOW!                        
> OpenGL version string: 2.1.2 NVIDIA 180.22                                     
> OpenGL extensions:                                                             
>     GL_ARB_color_buffer_float, GL_ARB_depth_texture, GL_ARB_draw_buffers,      
>     GL_ARB_draw_instanced, GL_ARB_fragment_program,                            
>     GL_ARB_fragment_program_shadow, GL_ARB_fragment_shader,                    
>     GL_ARB_half_float_pixel, GL_ARB_half_float_vertex,                         
>     GL_ARB_framebuffer_object, GL_ARB_geometry_shader4, GL_ARB_imaging,        
>     GL_ARB_multisample, GL_ARB_multitexture, GL_ARB_occlusion_query,           
>     GL_ARB_pixel_buffer_object, GL_ARB_point_parameters, GL_ARB_point_sprite,  
>     GL_ARB_shadow, GL_ARB_shader_objects, GL_ARB_shading_language_100,         
>     GL_ARB_texture_border_clamp, GL_ARB_texture_buffer_object,                 
>     GL_ARB_texture_compression, GL_ARB_texture_cube_map,                       
>     GL_ARB_texture_env_add, GL_ARB_texture_env_combine,                        
>     GL_ARB_texture_env_dot3, GL_ARB_texture_float,                             
>     GL_ARB_texture_mirrored_repeat, GL_ARB_texture_non_power_of_two,           
>     GL_ARB_texture_rectangle, GL_ARB_transpose_matrix,                         
>     GL_ARB_vertex_array_object, GL_ARB_vertex_buffer_object,                   
>     GL_ARB_vertex_program, GL_ARB_vertex_shader, GL_ARB_window_pos,             
>     GL_ATI_draw_buffers, GL_ATI_texture_float, GL_ATI_texture_mirror_once,     
>     GL_S3_s3tc, GL_EXT_texture_env_add, GL_EXT_abgr, GL_EXT_bgra,              
>     GL_EXT_blend_color, GL_EXT_blend_equation_separate,                        
>     GL_EXT_blend_func_separate, GL_EXT_blend_minmax, GL_EXT_blend_subtract,    
>     GL_EXT_compiled_vertex_array, GL_EXT_Cg_shader, GL_EXT_bindable_uniform,   
>     GL_EXT_depth_bounds_test, GL_EXT_direct_state_access,                      
>     GL_EXT_draw_buffers2, GL_EXT_draw_instanced, GL_EXT_draw_range_elements,   
>     GL_EXT_fog_coord, GL_EXT_framebuffer_blit, GL_EXT_framebuffer_multisample, 
>     GL_EXT_framebuffer_object, GL_EXTX_framebuffer_mixed_formats,              
>     GL_EXT_framebuffer_sRGB, GL_EXT_geometry_shader4,                          
>     GL_EXT_gpu_program_parameters, GL_EXT_gpu_shader4,                         
>     GL_EXT_multi_draw_arrays, GL_EXT_packed_depth_stencil,                     
>     GL_EXT_packed_float, GL_EXT_packed_pixels, GL_EXT_pixel_buffer_object,     
>     GL_EXT_point_parameters, GL_EXT_rescale_normal, GL_EXT_secondary_color,    
>     GL_EXT_separate_specular_color, GL_EXT_shadow_funcs,                       
>     GL_EXT_stencil_two_side, GL_EXT_stencil_wrap, GL_EXT_texture3D,            
>     GL_EXT_texture_array, GL_EXT_texture_buffer_object,                        
>     GL_EXT_texture_compression_latc, GL_EXT_texture_compression_rgtc,          
>     GL_EXT_texture_compression_s3tc, GL_EXT_texture_cube_map,                   
>     GL_EXT_texture_edge_clamp, GL_EXT_texture_env_combine,                     
>     GL_EXT_texture_env_dot3, GL_EXT_texture_filter_anisotropic,                
>     GL_EXT_texture_integer, GL_EXT_texture_lod, GL_EXT_texture_lod_bias,       
>     GL_EXT_texture_mirror_clamp, GL_EXT_texture_object, GL_EXT_texture_sRGB,   
>     GL_EXT_texture_shared_exponent, GL_EXT_timer_query, GL_EXT_vertex_array,   
>     GL_EXT_vertex_array_bgra, GL_IBM_rasterpos_clip,                           
>     GL_IBM_texture_mirrored_repeat, GL_KTX_buffer_region, GL_NV_blend_square,  
>     GL_NV_copy_depth_to_color, GL_NV_depth_buffer_float,                       
>     GL_NV_conditional_render, GL_NV_depth_clamp, GL_NV_explicit_multisample,   
>     GL_NV_fence, GL_NV_float_buffer, GL_NV_fog_distance,                       
>     GL_NV_fragment_program, GL_NV_fragment_program_option,                     
>     GL_NV_fragment_program2, GL_NV_framebuffer_multisample_coverage,           
>     GL_NV_geometry_shader4, GL_NV_gpu_program4, GL_NV_half_float,              
>     GL_NV_light_max_exponent, GL_NV_multisample_coverage,                      
>     GL_NV_multisample_filter_hint, GL_NV_occlusion_query,                      
>     GL_NV_packed_depth_stencil, GL_NV_parameter_buffer_object,                 
>     GL_NV_pixel_data_range, GL_NV_point_sprite, GL_NV_primitive_restart,       
>     GL_NV_register_combiners, GL_NV_register_combiners2,                       
>     GL_NV_texgen_reflection, GL_NV_texture_compression_vtc,                    
>     GL_NV_texture_env_combine4, GL_NV_texture_expand_normal,                   
>     GL_NV_texture_rectangle, GL_NV_texture_shader, GL_NV_texture_shader2,      
>     GL_NV_texture_shader3, GL_NV_transform_feedback,                           
>     GL_NV_transform_feedback2, GL_NV_vertex_array_range,                       
>     GL_NV_vertex_array_range2, GL_NV_vertex_program, GL_NV_vertex_program1_1,  
>     GL_NV_vertex_program2, GL_NV_vertex_program2_option,                       
>     GL_NV_vertex_program3, GL_NVX_conditional_render, GL_SGIS_generate_mipmap, 
>     GL_SGIS_texture_lod, GL_SGIX_depth_texture, GL_SGIX_shadow,                
>     GL_SUN_slice_accum                                                          
>  
>    visual  x  bf lv rg d st colorbuffer ax dp st accumbuffer  ms  cav
>  id dep cl sp sz l  ci b ro  r  g  b  a bf th cl  r  g  b  a ns b eat
> ----------------------------------------------------------------------
> 0x21 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x22 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x24 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x25 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x26 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x27 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x28 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x29 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x2a 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x2b 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x2c 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x2d 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x2e 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x2f 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x30 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x31 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x32 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x33 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x34 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x35 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x36 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x37 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x38 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x39 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x3a 24 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x3b 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x3c 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x3d 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x3e 24 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x3f 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x40 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x41 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x42 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x43 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x44 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x45 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x46 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x47 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x48 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x49 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x4a 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x4b 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x4c 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x4d 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x4e 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x4f 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x50 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x51 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x52 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x53 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x54 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x55 24 dc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x56 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x57 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x58 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x59 24 dc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x23 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x5a 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x5b 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x5c 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  0 0 None
> 0x5d 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x5e 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x5f 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x60 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x61 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x62 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x63 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x64 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4  0  0 16 16 16 16  0 0 None
> 0x65 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x66 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x67 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x68 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x69 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x6a 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x6b 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x6c 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  0 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x6d 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x6e 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x6f 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x70 32 tc  0 32  0 r  y  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x71 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x72 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  2 1 Ncon
> 0x73 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  0  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
> 0x74 32 tc  0 32  0 r  .  .  8  8  8  8  4 24  8 16 16 16 16  4 1 Ncon
>  
> So.... any other suggestions?
>  
> Thanks
>  
> Fernanda
>
>
> __________________________________________________________________
> Instant Messaging, free SMS, sharing photos and more... Try the new Yahoo! Canada Messenger at http://ca.beta.messenger.yahoo.com/ 

-- 
NIH Resource for Macromolecular Modeling and Bioinformatics
Beckman Institute for Advanced Science and Technology
University of Illinois, 405 N. Mathews Ave, Urbana, IL 61801
Email: johns_at_ks.uiuc.edu                 Phone: 217-244-3349
  WWW: http://www.ks.uiuc.edu/~johns/      Fax: 217-244-6078