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VMD (current) Compound Index

  _  
colvarbias_restraint_linear   myFl_Chart   
_py3_inittab   colvarbias_restraint_moving   myglwindow   
  A  
colvarbias_ti   
  N  
abuf   colvardeps   n_matrix (UIestimator)   
ANARIDisplayDevice   colvardeps::feature   n_vector (UIestimator)   
ANARIRender   colvardeps::feature_state   NameList   
Animation   colvarmodule   NanoShaperCoord   
anr_cylinder_array_color   colvarmodule::matrix2d   NanoShaperFace   
anr_directional_light   colvarmodule::matrix2d::row   NanoShaperInterface   
anr_material   colvarmodule::quaternion   netint   
anr_positional_light   colvarmodule::rmatrix   nvencfctns   
anr_sphere_array_color   colvarmodule::rotation   NVENCMgr   
anr_trimesh_v3f_n3f_c3f   colvarmodule::rvector   
  O  
ArithmeticPathBase (ArithmeticPathCV)   colvarmodule::vector1d   occthrparms_t   
ArtDisplayDevice   colvarparams   oglhandle   
atom   colvarparse   OpenGLCache   
atom_group   colvarparse::read_block   OpenGLDisplayDevice   
AtomColor   colvarproxy   OpenGLExtensions   
AtomData   colvarproxy_atom_groups   OpenGLPbufferDisplayDevice   
AtomEntry   colvarproxy_atoms   OpenGLRenderer   
AtomGrid   colvarproxy_io   OpenGLShader   
AtomGridCell   colvarproxy_replicas   OptiXDisplayDevice   
atomic_int_struct   colvarproxy_script   OptiXRenderer   
AtomList   colvarproxy_smp   Orbital   
atomparser_node   colvarproxy_system   orbital_cbdata   
atomparser_string   colvarproxy_tcl   orbthrparms   
AtomPosType   colvarproxy_vmd   ort_directional_light   
AtomRep   colvarproxy_volmaps   ort_material   
AtomRepDataInfo   colvarscript   ort_positional_light   
AtomRepParamStruct   colvarvalue   OsgNavigator   
AtomSel   Combinations   osp_cylinder_array_color   
atomsel_ctxt   Command   osp_directional_light   
atomsel_iterobject   CommandQueue   osp_material   
AtomSelThr   compile_data   osp_positional_light   
Axes   ComputeOccupancyMap_t   osp_sphere_array_color   
axis   CoorData   osp_trimesh_v3f_n3f_c3f   
  B  
CoorPluginData   OSPRay2DisplayDevice   
barrier_struct   ctxt   OSPRay2Renderer   
BaseMolecule   CUDAAccel   OSPRayDisplayDevice   
basis_atom_t   cudadevprops   OSPRayRenderer   
Best   CUDAMarchingCubes   
  P  
BinOfAtoms   CUDAQuickSurf   ParseTree   
bond   
  D  
PBCControls   
bondlist   DeltaCounter   PerRayData_radiance   
bondsearchthrparms   densitythrparms   PerRayData_shadow   
busbwthrparms   DepthSortObject   PhoneButtons   
Buttons   DirectionalLight   PhoneTracker   
  C  
DirectionalLightList   Pickable   
CaveButtons   DispCmdBeginRepGeomGroup   PickAtomCallbackEvent   
CaveDisplayDevice   DispCmdColorIndex   PickAtomEvent   
CaveScene   DispCmdComment   PickEvent   
CaveTracker   DispCmdCone   PickGraphicsEvent   
clusterparms_t   DispCmdCylinder   PickList   
CmdAddAtomSelMacro   DispCmdLatticeCubeArray   PickMode   
CmdAnimDelete   DispCmdLine   PickModeAddBond   
CmdAnimDir   DispCmdLineArray   PickModeAngles   
CmdAnimDup   DispCmdLineType   PickModeAtoms   
CmdAnimJump   DispCmdLineWidth   PickModeBonds   
CmdAnimNewFrame   DispCmdLitPointArray   PickModeCenter   
CmdAnimNewNumFrames   DispCmdPickPoint   PickModeDihedrals   
CmdAnimSkip   DispCmdPickPointArray   PickModeForce   
CmdAnimSpeed   DispCmdPoint   PickModeForceAtom   
CmdAnimStyle   DispCmdPointArray   PickModeForceFragment   
CmdAnimWriteFile   DispCmdPolyLineArray   PickModeForceResidue   
CmdColorChange   DispCmdSphere   PickModeList   
CmdColorItem   DispCmdSphereArray   PickModeMolLabel   
CmdColorName   DispCmdSphereRes   PickModeMove   
CmdColorScaleColors   DispCmdSphereType   PickModeMoveAtom   
CmdColorScaleMethod   DispCmdSquare   PickModeMoveFragment   
CmdColorScaleSettings   DispCmdText   PickModeMoveMolecule   
CmdDelAtomSelMacro   DispCmdTriangle   PickModeMoveRep   
CmdDisplayAAOn   DispCmdTriMesh   PickModeMoveResidue   
CmdDisplayAOAmbient   DispCmdTriStrips   PickModeUser   
CmdDisplayAODirect   DispCmdVolSlice   PickSelectionEvent   
CmdDisplayAOOn   DispCmdVolumeTexture   PickValueEvent   
CmdDisplayAxes   DispCmdWireMesh   PinchTool   
CmdDisplayBackgroundGradientOn   Displayable   PlainTextInterp   
CmdDisplayCacheMode   DisplayColor   plane   
CmdDisplayClip   DisplayDevice   PluginMgr   
CmdDisplayClipFar   DisplayFltkMenu   PointDistance   
CmdDisplayClipFarRel   DisplayRocker   PointGroupDefinition   
CmdDisplayClipNear   DrawForce   PositionalLight   
CmdDisplayClipNearRel   DrawMolecule   PositionalLightList   
CmdDisplayCueDensity   DrawMoleculeMonitor   POV3DisplayDevice   
CmdDisplayCueEnd   DrawMolItem   prim_t   
CmdDisplayCueMode   DrawTool   PrintTool   
CmdDisplayCueStart   
  E  
PSDisplayDevice   
CmdDisplayCullingOn   elementsummary   ptrstack   
CmdDisplayDepthcueOn   enthrparms   PyAtomSelObject   
CmdDisplayDoFFNumber   eventdataunion   PythonEvalEvent   
CmdDisplayDoFFocalDist   
  F  
PythonTextInterp   
CmdDisplayDoFOn   Feedback   
  Q  
CmdDisplayEyesep   FileChooserFltkMenu   qcprmsdthreadparms   
CmdDisplayFocallen   FileRenderer   QMData   
CmdDisplayFPSOn   FileRenderer::AdvancedLightState   QMTimestep   
CmdDisplayLightHL   FileRenderer::LightState   Quat   
CmdDisplayLightMove   FileRenderList   QuickSurf   
CmdDisplayLightOn   FileSpec   quicksurf_cbdata   
CmdDisplayLightRot   FindWithinData   
  R  
CmdDisplayProj   flint_t   R3dDisplayDevice   
CmdDisplayRenderMode   FltkOpenGLDisplayDevice   RadianceDisplayDevice   
CmdDisplayScreenDistance   FPS   RadiusCounter   
CmdDisplayScreenHeight   Fragment   RayShadeDisplayDevice   
CmdDisplayShadowOn   FrameEvent   rdfthrparms   
CmdDisplayStageLocation   FrameSelector   real_pcre   
CmdDisplayStagePanels   FreeVRButtons   real_pcre_extra   
CmdDisplayStageSize   FreeVRDisplayDevice   RenderFltkMenu   
CmdDisplayStereo   FreeVRScene   RenderManDisplayDevice   
CmdDisplayStereoSwap   FreeVRTracker   RepChoice   
CmdIMDConnect   
  G  
RepChoiceSmall   
CmdIMDCopyUnitCell   GaussianBlur   Residue   
CmdIMDRate   GelatoDisplayDevice   ResizeArray   
CmdIMDSim   GeometricPathBase (GeometricPathCV)   ResolutionCounter   
CmdLabelAdd   GeometryAngle   RibbonFrame   
CmdLabelAddspring   GeometryAtom   RotateTool   
CmdLabelDelete   GeometryBond   
  S  
CmdLabelShow   GeometryDihedral   sasathreadparms   
CmdLabelTextFormat   GeometryFltkMenu   SaveTrajectoryFltkMenu   
CmdLabelTextOffset   GeometryList   ScaleSpaceFilter   
CmdLabelTextSize   GeometryMol   Scene   
CmdLabelTextThickness   GeometryMonitor   Segmentation   
CmdMaterialAdd   GeometrySpring   SelectionBuilder   
CmdMaterialChange   GeomListStruct   SensorConfig   
CmdMaterialDefault   globmembwthrparms   shell_t   
CmdMaterialDelete   glsl_shader   ShortSlider   
CmdMaterialRename   glwin_ext_fctns   simenc_handle   
CmdMenuExtensionAdd   glwin_fbo_target   SmallRing   
CmdMenuExtensionRemove   glwin_warp_hmd   SmallRingLinkages   
CmdMenuShow   glxdata   SnapshotDisplayDevice   
CmdMobileMode   gofrparms_t   SortableArray   
CmdMolActive   gpuqcprmsdthreadparms   Spaceball   
CmdMolAddRep   gpuseg_temp_storage   SpaceballButtons   
CmdMolBondsRecalc   GrabTool   SpaceballEvent   
CmdMolCancel   GraphicsFltkMenu   spaceballevent   
CmdMolChangeRep   GraphicsFltkRep   spaceballhandle   
CmdMolChangeRepItem   GraphicsFltkRepBeads   SpaceballTracker   
CmdMolColor   GraphicsFltkRepBonds   SpringTool   
CmdMolDelete   GraphicsFltkRepCartoon   SQUARECELL   
CmdMolDeleteRep   GraphicsFltkRepCPK   Stack   
CmdMolDrawFrames   GraphicsFltkRepDotted   Stage   
CmdMolFix   GraphicsFltkRepDynamicBonds   state_t   
CmdMolLoad   GraphicsFltkRepFieldLines   StepCounter   
CmdMolMaterial   GraphicsFltkRepHBonds   STLDisplayDevice   
CmdMolNew   GraphicsFltkRepIsosurface   Surf   
CmdMolNumPeriodic   GraphicsFltkRepLicorice   symbol_data   
CmdMolOn   GraphicsFltkRepLines   SymbolTable   
CmdMolReanalyze   GraphicsFltkRepMSMS   SymbolTableElement   
CmdMolRename   GraphicsFltkRepNanoShaper   Symmetry   
CmdMolRep   GraphicsFltkRepNewCartoon   
  T  
CmdMolRepColorUpdate   GraphicsFltkRepNewRibbons   TachyonDisplayDevice   
CmdMolRepSelUpdate   GraphicsFltkRepOrbital   TclEvalEvent   
CmdMolScaleMinmax   GraphicsFltkRepOrbital::minmax   TclTextInterp   
CmdMolSelect   GraphicsFltkRepPoints   TextInterp   
CmdMolShowInstances   GraphicsFltkRepQuickSurf   Timestep   
CmdMolShowPeriodic   GraphicsFltkRepRibbons   TimestepEvent   
CmdMolShowRep   GraphicsFltkRepSolvent   Tool   
CmdMolSmoothRep   GraphicsFltkRepSurf   ToolFltkMenu   
CmdMolSSRecalc   GraphicsFltkRepTrace   TrajectoryReadEvent   
CmdMolTop   GraphicsFltkRepTube   TRIANGLE   
CmdMolVolume   GraphicsFltkRepVDW   TugTool   
CmdMouseMode   GraphicsFltkRepVolumeSlice   
  U  
CmdPluginUpdate   GraphicsFltkRepVolumetric   UIestimator (UIestimator)   
CmdRender   GraphicsFltkRepVolumetric::minmax   UIObject   
CmdRenderOption   GraphLabelEvent   UIText   
CmdResetView   GraphLayout   UIVR   
CmdRockOff   GRIDCELL   UserKeyEvent   
CmdRockOn   GridList   
  V  
CmdRotate   GridResCounter   Vector3D   
CmdRotMat   GridSearchPair   VideoStream   
CmdScale   GridSearchPairlist   vmd_cylinder   
CmdSpaceballMode   group_t   vmd_cylinder_color   
CmdToolAddDevice   
  H  
vmd_opencl_orbital_handle   
CmdToolCallback   hash_node_t   vmd_ring_color   
CmdToolChange   hash_t   vmd_sphere   
CmdToolCreate   HelpEvent   vmd_sphere_color   
CmdToolDelete   hersheyhandle   vmd_tricolor   
CmdToolDeleteDevice   HMDMgr   vmd_trimesh_c4u_n3b_v3f   
CmdToolOffset   
  I  
vmd_trimesh_n3b_v3f   
CmdToolRep   IdList   vmd_trimesh_n3f_v3f   
CmdToolScale   IMDEnergies   vmd_trimesh_v3f   
CmdToolScaleForce   IMDheader   VMDApp   
CmdToolScaleSpring   IMDMgr   VMDClipPlane   
CmdTranslate   IMDSim   VMDCollab   
ColorFltkMenu   IMDSimBlocking   VMDDIR   
ColorScale   IMDSimThread   VMDDisplayList   
ColorscaleImage   IndexList   VMDDisplayList::VMDLinkIter   
colvar   Inform   VMDFltkMenu   
colvar::alpha_angles   InitializeStructureEvent   VMDMenu   
colvar::angle   integrate_potential   VMDTempFile   
colvar::aspathCV   InterpEvent   VMDTitle   
colvar::azpathCV   InterpParams_t   VMDTkinterMenu   
colvar::cartesian   inthash_node_t   VMDTkMenu   
colvar::CartesianBasedPath   inthash_t   VMDTracker   
colvar::componentDisabled   intstack   vmdwinjoystick   
colvar::coordnum   IsoContour   VolMapCreate   
colvar::CVBasedPath   IsoSlider   VolMapCreateCoulombPotential   
colvar::cvc   IsoSurface   VolMapCreateCoulombPotentialMSM   
colvar::dihedPC   isosurface_cbdata   VolMapCreateDensity   
colvar::dihedral   
  J  
VolMapCreateDistance   
colvar::dipole_angle   JoystickTool   VolMapCreateILS   
colvar::dipole_magnitude   JRegex   VolMapCreateInterp   
colvar::distance   JString   VolMapCreateMask   
colvar::distance_dir   
  L  
VolMapCreateOccupancy   
colvar::distance_inv   latthrparms   VolumeTexture   
colvar::distance_pairs   LibGelatoDisplayDevice   VolumetricData   
colvar::distance_vec   LibTachyonDisplayDevice   VRJugglerButtons   
colvar::distance_xy   LINE   VRJugglerDisplayDevice   
colvar::distance_z   linenoiseCompletions   VRJugglerScene   
colvar::eigenvector   linenoiseState   VRJugglerSharedData   
colvar::groupcoordnum   LinkageEdge   VRJugglerTracker   
colvar::gspath   LinkagePath   Vrml2DisplayDevice   
colvar::gspathCV   LogfileEvent   VrmlDisplayDevice   
colvar::gyration   
  M  
VRPNButtons   
colvar::gzpath   M_VRJapp   VRPNFeedback   
colvar::gzpathCV   maddthrparms   VRPNTracker   
colvar::h_bond   MainFltkMenu   VRPNTrackerUserData   
colvar::inertia   match_data   VSMsgHeader_t   
colvar::inertia_z   Material   
  W  
colvar::linearCombination   MaterialFltkMenu   Watershed   
colvar::map_total   MaterialList   watershed_gpu_state_t   
colvar::orientation   Matrix4   wavef_signa_t   
colvar::orientation_angle   MayaDisplayDevice   WavefrontDisplayDevice   
colvar::orientation_proj   Mobile   Wavefunction   
colvar::polar_phi   MobileButtons   Win32Joystick   
colvar::polar_theta   MobileDeviceCommandEvent   wkf_cpu_caps_struct   
colvar::rmsd   MobileEvent   wkf_run_barrier_struct   
colvar::selfcoordnum   mobilehandle   wkf_shared_iterator_struct   
colvar::spin_angle   MobileStateChangedEvent   wkf_tasktile_struct   
colvar::tilt   MobileTracker   wkf_threadlaunch_struct   
colvar_grid   MolAtom   wkf_threadpool_struct   
colvar_grid_count   MolBrowser   wkf_threadpool_workerdata_struct   
colvar_grid_gradient   MolData   wkf_tilestack_t   
colvar_grid_scalar   Molecule   wkf_timer   
colvarbias   MoleculeEvent   wkfmsgtimer   
colvarbias_abf   MoleculeGraphics   wrap_nvml_handle   
colvarbias_alb   MoleculeList   wrap_nvmlPciInfo_t   
colvarbias_histogram   MolFilePlugin   
  X  
colvarbias_meta   Mouse   X3DDisplayDevice   
colvarbias_meta::hill   MouseModeEvent   X3DOMDisplayDevice   
colvarbias_restraint   MousePositionEvent   xidevhandle   
colvarbias_restraint_centers   Msmpot_t   xinputhandle   
colvarbias_restraint_centers_moving   MsmpotCuda_t   XY   
colvarbias_restraint_harmonic   MSMSCoord   XYZ   
colvarbias_restraint_harmonic_walls   MSMSFace   
  Y  
colvarbias_restraint_histogram   MSMSInterface   yy_buffer_state   
colvarbias_restraint_k   My_Fl_Positioner   YYSTYPE   
colvarbias_restraint_k_moving   myBrowser   yytoktype   

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