- u -
- unblock()
: CollectionMaster::CollectVectorSequence
- unblockPositions()
: CollectionMaster
- unchecked_insert()
: IRSet
- ungridCalc()
: ComputePmeMgr
- ungridForces()
: ComputePme
- uniform()
: Random
- uniform_array_f()
: Random
- uniq()
: SortableResizeArray< Type >
- UniqueSet()
: UniqueSet< Elem >
- UniqueSetIter()
: UniqueSetIter< Type >
- UniqueSetRaw()
: UniqueSetRaw< Elem >
- UniqueSortedArray()
: UniqueSortedArray< Type >
- unit()
: Vector
- units()
: ParseOptions
- unpack()
: GridforceFullBaseGrid
, GridforceFullMainGrid
, GridforceFullSubGrid
, GridforceLiteGrid
, MigrateAtomsMsg
, MigrateAtomsCombinedMsg
, PatchMap
, MovePatchesMsg
, ProxyResultMsg
, ProxySpanningTreeMsg
, TupleSignature
, AtomSignature
, ExclusionSignature
, DataStreamMsg
, ComputeConsForceMsg
, ComputeDPMEDataMsg
, ComputeDPMEResultsMsg
, ComputeGlobalDataMsg
, ComputeGlobalResultsMsg
, ComputeMap
, GridforceGrid
- unpack_data()
: MGridforceParamsList
- unpack_grid()
: GridforceGrid
- unregisterAvgPositionPickup()
: Patch
- unregisterBornRadPickup()
: Patch
- unregisterBoxesOnPe()
: CudaComputeNonbonded
- unregisterDEdaSumDeposit()
: Patch
- unregisterDHdrPrefixPickup()
: Patch
- unregisterForceDeposit()
: Patch
- unregisterIDsCompAtomExt()
: AtomMapper
- unregisterIDsFullAtom()
: AtomMapper
- unregisterIntRadPickup()
: Patch
- unregisterLcpoTypePickup()
: Patch
- unregisterPatch()
: PatchMap
- unregisterPositionPickup()
: Patch
- unregisterProxy()
: ProxyMgr
, HomePatch
- unregisterPsiSumDeposit()
: Patch
- unregisterVelocityPickup()
: Patch
- unscale()
: Lattice
- unsubscribe()
: BroadcastMgr
- update()
: ComputeBondedCUDAKernel
, ComputeCUDAMgr
, ComputeMsmMgr
, eABF
, eABF1D
, eABF2D
- update_atom_properties()
: colvarproxy_namd
- update_atoms_map()
: colvarproxy_namd
- update_dHdrPrefix()
: CudaComputeGBISKernel
- update_group_properties()
: colvarproxy_namd
- updateBornRad()
: CudaComputeGBISKernel
- updateComputes()
: CudaTileListKernel
, ComputeMgr
- updateComputes2()
: ComputeMgr
- updateComputes3()
: ComputeMgr
- updateComputesReady()
: LdbCoordinator
- UpdateCOMs()
: ARestraintManager
, ARestraint
- updateGridScale()
: Node
- updateIntRad()
: CudaComputeGBISKernel
- updateLocalComputes()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes2()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes3()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes4()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes5()
: ComputeMgr
- UpdateLocalLBInfo()
: NamdHybridLB
- updateLower()
: msm::GridFixed< T, N >
, msm::Grid< T >
- updateMolInfo()
: ParallelIOMgr
- updateTables()
: CudaNonbondedTables
- updateVdwTypesExcl()
: CudaComputeNonbondedKernel
- upstreamNeighbors()
: PatchMap
- use_imd()
: IMDOutput
- useController()
: NamdState
- useSequencer()
: HomePatch