- a -

• altLoc : mdio_Pdbatom_t
• angle : ForceEnergy_tag, ForceParam_tag
• angle_len : ForceParam_tag
• angleprm : ForceParam_tag
• angleprm_len : ForceParam_tag
• approx : MgridParam_tag
• atom : StepParam_tag, ForceParam_tag
• atom_len : ForceParam_tag
• atomprm : ForceParam_tag
• atomprm_len : ForceParam_tag

- b -

• bond : ForceEnergy_tag, ForceParam_tag
• bond_len : ForceParam_tag
• bondprm : ForceParam_tag
• bondprm_len : ForceParam_tag
• bound : ForceEnergy_tag
• boundary : MgridParam_tag

- c -

• cellstatus : mdio_DcdHeader_t
• center : MgridParam_tag, ForceParam_tag
• chainID : mdio_Pdbatom_t
• charge : MgridSystem_tag, mdio_Pdbatom_t
• cutoff : MgridParam_tag, ForceParam_tag

- d -

• dielectric : ForceParam_tag
• dihed : ForceEnergy_tag, ForceParam_tag
• dihed_len : ForceParam_tag
• dihedprm : ForceParam_tag
• dihedprm_len : ForceParam_tag

- e -

• elec : ForceEnergy_tag
• elec_const : ForceParam_tag
• elec_cutoff : ForceParam_tag
• element : mdio_Pdbatom_t
• excl : ForceParam_tag
• excl_len : ForceParam_tag
• excl_list : MgridSystem_tag
• exp1 : ForceParam_tag
• exp2 : ForceParam_tag

- f -

• f : ForceResult_tag
• f_angle : ForceResult_tag
• f_bond : ForceResult_tag
• f_bound : ForceResult_tag
• f_dihed : ForceResult_tag
• f_elec : MgridSystem_tag, ForceResult_tag
• f_impr : ForceResult_tag
• f_long : MgridSystem_tag
• f_short : MgridSystem_tag
• f_vdw : ForceResult_tag
• filename : mdio_ConfigData_t
• firststep : mdio_DcdHeader_t
• flags : ForceParam_tag
• force : StepSystem_tag
• force_compute : StepParam_tag
• force_object : StepParam_tag
• framestepcnt : mdio_DcdHeader_t

- i -

• iCode : mdio_Pdbatom_t
• impr : ForceEnergy_tag, ForceParam_tag
• impr_len : ForceParam_tag
• imprprm : ForceParam_tag
• imprprm_len : ForceParam_tag
• is_force_valid : StepSystem_tag

- k -

• keyword : mdio_ConfigData_t
• kinetic_energy : StepSystem_tag
• konst1 : ForceParam_tag
• konst2 : ForceParam_tag

- l -

• length : MgridParam_tag
• length1 : ForceParam_tag
• length2 : ForceParam_tag
• linenum : mdio_ConfigData_t

- n -

• name : mdio_Pdbatom_t
• natoms : MgridParam_tag, StepParam_tag, mdio_DcdHeader_t
• nbfixprm : ForceParam_tag
• nbfixprm_len : ForceParam_tag
• ndegfreedom : StepParam_tag
• nlevels : MgridParam_tag
• nspacings : MgridParam_tag

- o -

• occupancy : mdio_Pdbatom_t

- p -

• pe : ForceEnergy_tag
• pos : MgridSystem_tag, StepSystem_tag

- r -

• radius1 : ForceParam_tag
• radius2 : ForceParam_tag
• random_seed : StepParam_tag
• record : mdio_Pdbatom_t
• resName : mdio_Pdbatom_t
• resSeq : mdio_Pdbatom_t

- s -

• scaled14_list : MgridSystem_tag
• scaling14 : MgridSystem_tag, ForceParam_tag
• segID : mdio_Pdbatom_t
• serial : mdio_Pdbatom_t
• short_force : Mgrid_tag
• spacing : MgridParam_tag
• split : MgridParam_tag
• switchdist : ForceParam_tag

- t -

• temperature : StepSystem_tag
• tempFactor : mdio_Pdbatom_t
• timestep : StepParam_tag, mdio_DcdHeader_t

- u -

• u_elec : MgridSystem_tag
• u_long : MgridSystem_tag
• u_short : MgridSystem_tag

- v -

• value : mdio_ConfigData_t
• vdw : ForceEnergy_tag
• vdw_cutoff : ForceParam_tag
• vec1 : mdio_DcdCell_t
• vec2 : mdio_DcdCell_t
• vec3 : mdio_DcdCell_t
• vel : StepSystem_tag

- x -

• xlen : ForceParam_tag

- y -

• ylen : ForceParam_tag

- z -

• zlen : ForceParam_tag

---