- a -

• adt_appendList() : list.h
• adt_cleanupArray() : array.h
• adt_cleanupList() : list.h
• adt_cleanupTable() : table.h
• adt_createArray() : array.h
• adt_createList() : list.h
• adt_createTable() : table.h
• adt_deleteList() : list.h
• adt_deleteTable() : table.h
• adt_destroyArray() : array.h
• adt_destroyList() : list.h
• adt_destroyTable() : table.h
• adt_getDataArray() : array.h
• adt_getDataList() : list.h
• adt_getElemsizeArray() : array.h
• adt_getElemsizeList() : list.h
• adt_getLengthArray() : array.h
• adt_getLengthList() : list.h
• adt_getStatsTable() : table.h
• adt_indexArray() : array.h
• adt_indexList() : list.h
• adt_initializeArray() : array.h
• adt_initializeList() : list.h
• adt_initializeTable() : table.h
• adt_insertTable() : table.h
• adt_lookupTable() : table.h
• adt_resizeArray() : array.h
• adt_resizeList() : list.h
• adt_updateArray() : array.h
• adt_updateList() : list.h
• adt_updateTable() : table.h

- d -

• delete_Step() : step.h

- f -

• force_cleanup() : force.h
• force_compute() : force.h
• force_compute_angle_interaction() : compute.h
• force_compute_angles() : compute.h
• force_compute_bond_interaction() : compute.h
• force_compute_bonds() : compute.h
• force_compute_bres_cylinder() : compute.h
• force_compute_bres_sphere() : compute.h
• force_compute_dihedrals() : compute.h
• force_compute_domain_update() : compute.h
• force_compute_impropers() : compute.h
• force_compute_nbpairs_direct() : compute.h
• force_compute_nbpairs_elec_shifted() : compute.h
• force_compute_nbpairs_elec_standard() : compute.h
• force_compute_nbpairs_geomhash() : compute.h
• force_compute_nbpairs_gridcells() : compute.h
• force_compute_nbpairs_subtexcl() : compute.h
• force_compute_nbpairs_vdw_buck() : compute.h
• force_compute_nbpairs_vdw_bucknd() : compute.h
• force_compute_nbpairs_vdw_standard() : compute.h
• force_compute_nbpairs_vdw_switchbuck() : compute.h
• force_compute_nbpairs_vdw_switchbucknd() : compute.h
• force_compute_nbpairs_vdw_switched() : compute.h
• force_compute_scaled_coords() : compute.h
• force_compute_torsion_interaction() : compute.h
• force_create() : force.h
• force_destroy() : force.h
• force_domain_cleanup() : fdomain.h
• force_domain_create() : fdomain.h
• force_domain_destroy() : fdomain.h
• force_domain_initialize() : fdomain.h
• force_get_excl_list() : force.h
• force_get_poswrap() : force.h
• force_get_scaled14_list() : force.h
• force_get_scaled_coords() : force.h
• force_initialize() : force.h
• force_param_cleanup() : fparam.h
• force_param_create() : fparam.h
• force_param_destroy() : fparam.h
• force_param_initialize() : fparam.h
• force_result_cleanup() : fresult.h
• force_result_create() : fresult.h
• force_result_destroy() : fresult.h
• force_result_initialize() : fresult.h
• force_select_cleanup() : fselect.h
• force_select_create() : fselect.h
• force_select_destroy() : fselect.h
• force_select_initialize() : fselect.h
• force_select_reset_force() : fselect.h
• force_select_reset_potential() : fselect.h
• force_update_domain() : force.h

- m -

• mdio_cleanupBincoord() : bincoord.h
• mdio_cleanupConfig() : config.h
• mdio_cleanupDcd() : dcd.h
• mdio_cleanupFile() : file.h
• mdio_cleanupParam() : param.h
• mdio_cleanupPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_cleanupTopo() : topo.h
• mdio_closeFile() : file.h
• mdio_createBincoord() : bincoord.h
• mdio_createConfig() : config.h
• mdio_createDcd() : dcd.h
• mdio_createFile() : file.h
• mdio_createParam() : param.h
• mdio_createPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_createTopo() : topo.h
• mdio_destroyBincoord() : bincoord.h
• mdio_destroyConfig() : config.h
• mdio_destroyDcd() : dcd.h
• mdio_destroyFile() : file.h
• mdio_destroyParam() : param.h
• mdio_destroyPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_destroyTopo() : topo.h
• mdio_getAngleParam() : param.h
• mdio_getAngleTopo() : topo.h
• mdio_getAtomParam() : param.h
• mdio_getAtomPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_getAtomTopo() : topo.h
• mdio_getBincoord() : bincoord.h
• mdio_getBondParam() : param.h
• mdio_getBondTopo() : topo.h
• mdio_getBytenumFile() : file.h
• mdio_getDataConfig() : config.h
• mdio_getDihedParam() : param.h
• mdio_getDihedTopo() : topo.h
• mdio_getErrorFile() : file.h
• mdio_getErrorMessageFile() : file.h
• mdio_getExclTopo() : topo.h
• mdio_getImprParam() : param.h
• mdio_getImprTopo() : topo.h
• mdio_getLinenumFile() : file.h
• mdio_getNameFile() : file.h
• mdio_getNbfixParam() : param.h
• mdio_getPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_getTypeFile() : file.h
• mdio_indexParamTopo() : topo.h
• mdio_initializeBincoord() : bincoord.h
• mdio_initializeConfig() : config.h
• mdio_initializeDcd() : dcd.h
• mdio_initializeFile() : file.h
• mdio_initializeParam() : param.h
• mdio_initializePdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_initializeTopo() : topo.h
• mdio_isEndOfFile() : file.h
• mdio_openFile() : file.h
• mdio_readBinaryFile() : file.h
• mdio_readBincoord() : bincoord.h
• mdio_readConfig() : config.h
• mdio_readLineFile() : file.h
• mdio_readParam() : param.h
• mdio_readPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_readTextFile() : file.h
• mdio_readTopo() : topo.h
• mdio_resetErrorFile() : file.h
• mdio_seekFile() : file.h
• mdio_setAtomPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_setBincoord() : bincoord.h
• mdio_setErrorFile() : file.h
• mdio_setErrorHandlerFile() : file.h
• mdio_setErrorMessageFile() : file.h
• mdio_setPdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_writeBeginDcd() : dcd.h
• mdio_writeBinaryFile() : file.h
• mdio_writeBincoord() : bincoord.h
• mdio_writeEndDcd() : dcd.h
• mdio_writeFrameDcd() : dcd.h
• mdio_writeHeaderDcd() : dcd.h
• mdio_writePdbcoord() : pdbcoord.h
• mdio_writeTextFile() : file.h
• mgrid_approx_to_string() : mgrid.h
• mgrid_boundary_to_string() : mgrid.h
• mgrid_done() : mgrid.h
• mgrid_exact_smooth() : mgrid.h
• mgrid_force() : mgrid.h
• mgrid_init() : mgrid.h
• mgrid_param_config() : mgrid.h
• mgrid_setup() : mgrid.h
• mgrid_split_to_string() : mgrid.h
• mgrid_string_to_approx() : mgrid.h
• mgrid_string_to_boundary() : mgrid.h
• mgrid_string_to_split() : mgrid.h
• mgrid_system_validate() : mgrid.h

- n -

• new_Step() : step.h

- r -

• random_gaussian() : random.h
• random_gaussian_vector() : random.h
• random_init() : random.h
• random_initseed() : random.h
• random_integer() : random.h
• random_split() : random.h
• random_uniform() : random.h

- s -

• step_cleanup() : step.h
• step_compute() : step.h
• step_errmsg() : step.h
• step_setup() : step.h

---