- p -

• PACK_MSG() : CollectionMaster.C , ComputeDPMEMsgs.C , MigrateAtomsMsg.C , ProxyMgr.C , ComputeGlobalMsgs.C
• packSend() : DataExchanger.C , DataExchanger.h
• pad() : dcdlib.C
• pairlist_from_pairlist() : ComputeNonbondedInl.h
• pairlistFromAll() : ComputeGBIS.C
• parse_input_macro() : ParseOptions.C
• parse_input_macro_b() : ParseOptions.C
• parse_input_macro_default() : ParseOptions.C
• parse_input_macro_default_b() : ParseOptions.C
• parse_stringlist_macro() : ParseOptions.C
• partition() : SortAtoms.C
• passb() : pub3dfft.C
• passb2() : pub3dfft.C
• passb3() : pub3dfft.C
• passb4() : pub3dfft.C
• passb5() : pub3dfft.C
• passf() : pub3dfft.C
• passf2() : pub3dfft.C
• passf3() : pub3dfft.C
• passf4() : pub3dfft.C
• passf5() : pub3dfft.C
• pdb_field_str2enum() : colvarproxy_namd.C
• Phase2_Pair() : ComputeGBIS.inl
• Phase2_PairSer() : ComputeGBISser.C
• Pme_init() : ComputePme.C
• PmeSlabSendTrans() : ComputePme.C
• PmeSlabSendUngrid() : ComputePme.C
• PmeSlabSendUntrans() : ComputePme.C
• PmeXPencilSendUntrans() : ComputePme.C
• PmeXZPencilFFT() : ComputePme.C
• PmeYPencilBackwardFFT() : ComputePme.C
• PmeYPencilForwardFFT() : ComputePme.C
• PmeYPencilSendTrans() : ComputePme.C
• PmeYPencilSendUntrans() : ComputePme.C
• PmeZPencilSendTrans() : ComputePme.C
• PmeZPencilSendUngrid() : ComputePme.C
• pp_clamp() : PressureProfile.h
• pp_reduction() : PressureProfile.h
• print_Matrix4() : Matrix4.h , Matrix4.C
• print_status() : msm_setup.c
• PRINT_VECTOR() : ParseOptions.C
• ProblemParsing() : FreeEnergyParse.h , FreeEnergyParse.C
• proc_anglegrad() : TclCommands.C
• proc_dihedralgrad() : TclCommands.C
• proc_getangle() : TclCommands.C
• proc_getbond() : TclCommands.C
• proc_getdihedral() : TclCommands.C
• processCpuLoad() : ProxyMgr.C
• ProcessorPrivateInit() : ProcessorPrivate.h , ProcessorPrivate.C
• prolongation() : msm_longrng.c , msm_longrng_sprec.c
• prolongation_factored() : msm_longrng_sprec.c , msm_longrng.c
• psfgen_static_init() : ScriptTcl.C
• pubd3di() : pub3dfft.h , pub3dfft.C
• pubdz3d() : pub3dfft.C , pub3dfft.h
• pubz3d() : pub3dfft.h , pub3dfft.C
• pubz3di() : pub3dfft.h , pub3dfft.C
• pubzd3d() : pub3dfft.h , pub3dfft.C
• PUPbytes() : Lattice.h