Here is a list of all class members with links to the classes they belong to:
- u -
- u
: ComputeMsmMgr
, minpoint
- uelec
: NL_Msm_t
- uidata
: ParseOptions::DataElement
- uidef
: ParseOptions::DataElement
- UINT
: ParseOptions::DataElement
- uiptr
: ParseOptions::DataElement
- unblock()
: CollectionMaster::CollectVectorSequence
- unblockPositions()
: CollectionMaster
- unchecked_insert()
: IRSet
- UNDEF
: ParseOptions::DataElement
- ungridCalc()
: ComputePmeMgr
- ungridForces()
: ComputePme
- uniform()
: Random
- uniform_array_f()
: Random
- uniq()
: SortableResizeArray< Type >
- UniqueSet()
: UniqueSet< Elem >
- UniqueSet< Elem >
: UniqueSetRaw< Elem >
- UniqueSetIter()
: UniqueSetIter< Type >
- UniqueSetIter< Elem >
: UniqueSet< Elem >
, EntryGlob< Elem >
, UniqueSetRaw< Elem >
- UniqueSetRaw()
: UniqueSetRaw< Elem >
- UniqueSetRaw< Elem >
: Entry< Elem >
, EntryGlob< Elem >
- UniqueSortedArray()
: UniqueSortedArray< Type >
- UniqueSortedArray< Elem >
: ResizeArrayRaw< Type >
- unit()
: Vector
- unitcell
: ReplicaDcdDataMsg
- units
: ParseOptions::DataElement
, ParseOptions
- UNKNOWN
: PDBData
- unpack()
: DataStreamMsg
, ComputeConsForceMsg
, ComputeDPMEDataMsg
, ComputeDPMEResultsMsg
, ComputeGlobalDataMsg
, ComputeGlobalResultsMsg
, ComputeMap
, GridforceGrid
, GridforceFullBaseGrid
, GridforceFullMainGrid
, GridforceFullSubGrid
, GridforceLiteGrid
, MigrateAtomsMsg
, MigrateAtomsCombinedMsg
, PatchMap
, MovePatchesMsg
, ProxyResultMsg
, ProxySpanningTreeMsg
, TupleSignature
, AtomSignature
, ExclusionSignature
- unpack_data()
: MGridforceParamsList
- unpack_grid()
: GridforceGrid
- unregisterAvgPositionPickup()
: Patch
- unregisterBornRadPickup()
: Patch
- unregisterBoxesOnPe()
: CudaComputeNonbonded
- unregisterDEdaSumDeposit()
: Patch
- unregisterDHdrPrefixPickup()
: Patch
- unregisterForceDeposit()
: Patch
- unregisterIDsCompAtomExt()
: AtomMapper
- unregisterIDsFullAtom()
: AtomMapper
- unregisterIntRadPickup()
: Patch
- unregisterLcpoTypePickup()
: Patch
- unregisterPatch()
: PatchMap
- unregisterPositionPickup()
: Patch
- unregisterProxy()
: ProxyMgr
, HomePatch
- unregisterPsiSumDeposit()
: Patch
- unregisterVelocityPickup()
: Patch
- unscale()
: Lattice
- unsubscribe()
: BroadcastMgr
- update()
: eABF
, ComputeBondedCUDAKernel
, ComputeCUDAMgr
, ComputeMsmMgr
, eABF1D
, eABF2D
- update_atom_properties()
: colvarproxy_namd
- update_atoms_map()
: colvarproxy_namd
- update_dHdrPrefix()
: CudaComputeGBISKernel
- update_group_properties()
: colvarproxy_namd
- updateBornRad()
: CudaComputeGBISKernel
- updateComputes()
: CudaTileListKernel
, ComputeMgr
- updateComputes2()
: ComputeMgr
- updateComputes3()
: ComputeMgr
- updateComputesReady()
: LdbCoordinator
- UpdateCOMs()
: ARestraint
, ARestraintManager
- updateGridScale()
: Node
- updateIntRad()
: CudaComputeGBISKernel
- updateLocalComputes()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes2()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes3()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes4()
: ComputeMgr
- updateLocalComputes5()
: ComputeMgr
- UpdateLocalLBInfo()
: NamdHybridLB
- updateLower()
: msm::GridFixed< T, N >
, msm::Grid< T >
- updateMolInfo()
: ParallelIOMgr
- updateTables()
: CudaNonbondedTables
- updatetime
: wkfmsgtimer
- updateVdwTypesExcl()
: CudaComputeNonbondedKernel
- upperboundary
: eABF
- upstreamNeighbors()
: PatchMap
- UreyBradleyAt1
: AmberParm7Reader::Ambertoppar
- UreyBradleyAt2
: AmberParm7Reader::Ambertoppar
- UreyBradleyEquilValues
: AmberParm7Reader::Ambertoppar
- UreyBradleyForceConstants
: AmberParm7Reader::Ambertoppar
- UreyBradleyNum
: AmberParm7Reader::Ambertoppar
- USE_ATOM
: PDBAtom
- USE_HETATM
: PDBAtom
- use_imd()
: IMDOutput
- useAntecedent
: SimParameters
- useAvgPositions
: ComputeHomePatches
- useAVXTiles
: SimParameters
- useCkLoop
: SimParameters
- useCompressedPsf
: SimParameters
- useConstantArea
: SimParameters
- useConstantRatio
: SimParameters
- useController()
: NamdState
- useCUDA2
: SimParameters
- useCUDAdisable
: SimParameters
- usedevicelist
: cuda_args_t
- useDPME
: SimParameters
- useFlexibleCell
: SimParameters
- useGroupPressure
: SimParameters
- usePairlists
: nonbonded
, Flags
, SimParameters
, ComputeNonbondedCUDA
, ComputeNonbondedMIC
- usePluginIO
: SimParameters
- usePMECUDA
: SimParameters
- useSequencer()
: HomePatch
- useSettle
: SimParameters