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#                           STANDARD NAMD SETTINGS                            #
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set temperature 300
set path	#change it

paraTypeCharmm          on
parameters              ${path}/par_all27_prot_lipid.inp
structure				${path}/A.psf
coordinates				${path}/A.pdb

exclude          scaled1-4
1-4scaling       1.0
cutoff           12.0
switching        on
switchdist       10.0
pairlistdist     14

timestep         1.0
rigidbonds       all
nonbondedFreq    1
fullElectFrequency 2
stepspercycle    5 # fixed!!!

langevin         on
langevinDamping  1.0
langevinTemp     $temperature
langevinHydrogen on
langevinPiston   off

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#                                 COLVAR SETTINGS                             #
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# COLVARS module is used to measure the reaction coordinate
colvars       on
colvarsConfig ${path}/dihedral_20.colv