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File Members
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c
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d
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e
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f
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g
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i
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k
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m
|
n
|
p
|
r
|
s
|
u
|
v
|
w
- a -
atomData :
CompressPsf.C
atomNamePool :
CompressPsf.C
atomSigPool :
CompressPsf.C
atomTypePool :
CompressPsf.C
averageLoad :
ProxyMgr.C
- c -
charge :
ComputeNonbondedBase2.h
chargePool :
CompressPsf.C
coords :
ScriptTcl.C
cpuloads :
ProxyMgr.C
,
NamdCentLB.C
cpuTime_start :
BackEnd.C
- d -
dcdplugin :
ScriptTcl.C
debug :
parm.C
dout :
DataStream.h
,
DataStream.C
- e -
eachAtomClusterID :
CompressPsf.C
eachAtomExclSigs :
CompressPsf.C
eachAtomSigs :
CompressPsf.C
eachClusterSize :
CompressPsf.C
eventEndOfTimeStep :
Node.C
,
Controller.C
extraAngleParams :
CompressPsf.C
extraAngles :
CompressPsf.C
extraBondParams :
CompressPsf.C
extraBonds :
CompressPsf.C
extraDihedralParams :
CompressPsf.C
extraDihedrals :
CompressPsf.C
extraImproperParams :
CompressPsf.C
extraImpropers :
CompressPsf.C
- f -
filehandle :
ScriptTcl.C
firstphase :
ComputeMgr.C
- g -
g_cfgList :
CompressPsf.C
g_mol :
CompressPsf.C
g_param :
CompressPsf.C
g_simParam :
CompressPsf.C
gotsigint :
Controller.C
- i -
inNodeProxySpanDim :
ProxyMgr.h
,
ProxyMgr.C
iout :
InfoStream.h
,
InfoStream.C
- k -
kALittle :
FreeEnergyEnums.h
kAlmostMinusOne :
FreeEnergyEnums.h
kAlmostOne :
FreeEnergyEnums.h
kGroupMultiplier :
FreeEnergyGroup.h
kGroupNumToStart :
FreeEnergyGroup.h
kLambdaMultiplier :
FreeEnergyLambdMgr.h
kLambdaNumToStart :
FreeEnergyLambdMgr.h
kMultiplier :
FreeEnergyRMgr.h
kNumToStart :
FreeEnergyRMgr.h
kPi :
FreeEnergyEnums.h
- m -
massPool :
CompressPsf.C
memusageinitobject :
memusage.h
mHrmT :
Settle.C
mOrmT :
Settle.C
- n -
namd_build_date :
main.C
namd_build_machine :
main.C
namd_build_user :
main.C
node_molecule :
Node.C
node_parameters :
Node.C
node_simParameters :
Node.C
numatoms :
ScriptTcl.C
- p -
p_ij_x :
ComputeNonbondedBase2.h
p_ij_y :
ComputeNonbondedBase2.h
p_ij_z :
ComputeNonbondedBase2.h
pencilPMEProcessors :
ComputePme.C
procidx :
ProxyMgr.C
proxyRecvSpanning :
ProxyMgr.h
,
ProxyMgr.C
proxySendSpanning :
ProxyMgr.h
,
ProxyMgr.C
proxySpanDim :
ProxyMgr.h
,
ProxyMgr.C
- r -
ra :
Settle.C
rb :
Settle.C
rc :
Settle.C
resNamePool :
CompressPsf.C
rra :
Settle.C
- s -
scaling_factors :
ParseOptions.C
segNamePool :
CompressPsf.C
settle_first_time :
Settle.C
sigsOfAngles :
CompressPsf.C
sigsOfBonds :
CompressPsf.C
sigsOfCrossterms :
CompressPsf.C
sigsOfDihedrals :
CompressPsf.C
sigsOfExclusions :
CompressPsf.C
sigsOfImpropers :
CompressPsf.C
- u -
unit_string_array :
ParseOptions.C
useProxySync :
Sync.h
,
Sync.C
useSync :
Sync.h
,
Sync.C
- v -
vcoords :
ScriptTcl.C
vmdforces :
GlobalMasterIMD.C
- w -
wallTime_start :
BackEnd.C
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