Difference for src/GridForceGrid.C from version 1.23 to 1.24

version 1.23version 1.24
Line 179
Line 179
     msg->put(3*sizeof(float), (char*)gap);     msg->put(3*sizeof(float), (char*)gap);
     msg->put(3*sizeof(float), (char*)gapinv);     msg->put(3*sizeof(float), (char*)gapinv);
     msg->put(sizeof(Vector), (char*)&scale);     msg->put(sizeof(Vector), (char*)&scale);
      msg->put(sizeof(Bool), (char*)&checksize);
          
     DebugM(2, "Packing grid, size = " << size << "\n" << endi);     DebugM(2, "Packing grid, size = " << size << "\n" << endi);
          
Line 233
Line 234
     msg->get(3*sizeof(float), (char*)gap);     msg->get(3*sizeof(float), (char*)gap);
     msg->get(3*sizeof(float), (char*)gapinv);     msg->get(3*sizeof(float), (char*)gapinv);
     msg->get(sizeof(Vector), (char*)&scale);     msg->get(sizeof(Vector), (char*)&scale);
      msg->get(sizeof(Bool), (char*)&checksize);
          
     if (size) {     if (size) {
  DebugM(3, "allocating grid, size = " << size << "\n" << endi);  DebugM(3, "allocating grid, size = " << size << "\n" << endi);
Line 473
Line 475
  factor /= 0.0434;  // convert V -> kcal/mol*e  factor /= 0.0434;  // convert V -> kcal/mol*e
     }     }
     scale = mgridParams->gridforceScale;     scale = mgridParams->gridforceScale;
      checksize = mgridParams->gridforceCheckSize;
          
     // Allocate storage for potential and read it     // Allocate storage for potential and read it
     float *grid_nopad = new float[size_nopad];     float *grid_nopad = new float[size_nopad];
Line 550
Line 553
     // Check for grid overlap     // Check for grid overlap
     if (!fits_lattice(simParams->lattice)) {     if (!fits_lattice(simParams->lattice)) {
       char errmsg[512];       char errmsg[512];
       if (simParams->gridforcechecksize) {       if (checksize) {
         sprintf(errmsg, "Warning: Periodic cell basis too small for Gridforce grid %d.  Set gridforcechecksize off in configuration file to ignore.\n", mygridnum);         sprintf(errmsg, "Warning: Periodic cell basis too small for Gridforce grid %d.  Set gridforcechecksize off in configuration file to ignore.\n", mygridnum);
         NAMD_die(errmsg);               NAMD_die(errmsg);      
       }       }
Line 955
Line 958
  factor /= 0.0434;  // convert V -> kcal/mol*e  factor /= 0.0434;  // convert V -> kcal/mol*e
     }     }
     scale = mgridParams->gridforceScale;     scale = mgridParams->gridforceScale;
      checksize = mgridParams->gridforceCheckSize;
          
     for (int i = 0; i < 3; i++) {     for (int i = 0; i < 3; i++) {
  k[i] = k_nopad[i]; // subgrids aren't padded  k[i] = k_nopad[i]; // subgrids aren't padded
Line 1409
Line 1413
     msg->put(sizeof(Tensor), (char*)&e);     msg->put(sizeof(Tensor), (char*)&e);
     msg->put(sizeof(Tensor), (char*)&inv);     msg->put(sizeof(Tensor), (char*)&inv);
     msg->put(sizeof(Vector), (char*)&scale);     msg->put(sizeof(Vector), (char*)&scale);
      msg->put(sizeof(Bool), (char*)&checksize);
          
     msg->put(129*sizeof(char), (char*)filename);     msg->put(129*sizeof(char), (char*)filename);
          
Line 1430
Line 1435
     msg->get(sizeof(Tensor), (char*)&e);     msg->get(sizeof(Tensor), (char*)&e);
     msg->get(sizeof(Tensor), (char*)&inv);     msg->get(sizeof(Tensor), (char*)&inv);
     msg->get(sizeof(Vector), (char*)&scale);     msg->get(sizeof(Vector), (char*)&scale);
      msg->get(sizeof(Bool), (char*)&checksize);
          
     msg->get(129*sizeof(char), (char*)filename);     msg->get(129*sizeof(char), (char*)filename);
          

Legend:
Removed in v.1.23 
changed lines
 Added in v.1.24


Made by using version 1.53 of cvs2html